坚持实事求是，重视调查研究，是李时珍治学精神的又一突出表现。他在研究工作中，遇到问题，总是看了又看，听了再听，不断思索，尽最大限度地去直接调查了解。他开始写《白花蛇传》的时候，最初在药贩子那里找材料，但当他知道贩子所收的蛇，不全是真品时，就亲自多次跑到出蛇的龙峰山去观察了解，结果他不仅很清楚地看到了白花蛇的形状，活动规律，而且，还了解到了有关白花蛇的炮制方法等。为了证实陶弘景说的"穿山甲能水陆两栖，白天到岸上把鳞张开引蚂蚁爬来，引来后闭上鳞跳入水中，让蚂蚁浮在水面，然后吞掉"这幺一句话，他不知花费了多少个日日夜夜，蹲在穿山甲出没的地方，进行其生态活动的调查，并亲自解剖了一只穿山甲，发现它的胃很大，胃里确实有一升多蚂蚁，证明它确是食蚁动物，但食蚁的方式与前说不同，是搔开蚁穴舐食蚁类的，纠正了前书的错误。为了研究清楚专供皇帝服用的"仙果"到底是什幺东西，他冒着杀头之罪，前往均州（今湖北省均县），采摘样品，亲口尝试，证实所谓"仙果"不过是仅具有生津止渴作用的普通椰梅。正因为他非常重视调查研究，看重第一手资料，因而使他的著作具有很高的科学性。

　　李时珍在艰巨的研究工作中，不仅"无书不读"，涉猎诸家，而且，深入群众"采访四方"，农民、渔夫、猎人、樵夫，既是他的朋友，又是他的老师，他向捕鱼的请教鸬鸶的生育方法和鱼狗子的穴居情况。他研究萍、苹、、的形态差别，农民们便把他们所知道的标本都采集来供他看。

　　其主要著作有：

　　１．《本草纲目》：成书于公元１５７８年（明万历六年），全书共５２卷，收载药物１８９２种（其中３７４种为历代本草所不曾记载过的），附图１０００余幅。他废除了古老的上、中、下三品分类法，而以水、火、土、金石、草、谷、菜、果、木、服器、虫、鳞、介、禽、兽、人体附着物等十六部门、六十类，对所载药物一一作了详细介绍。对每味药物，都尽可能地阐述了性味、主治、用药法则、产地、形态、采集、炮制、方剂配伍等，全书还附各类方剂１１０９６则。《本草纲目》大约从１５９０年由金陵（南京）书商胡承龙开始刻印刊行以来，至今已有六十多种版本。在国外也被译成日、英、法、德、俄、朝鲜、拉丁等多种文字出版。

　　２．《濒湖脉学》：成书于公元１５６４年（明嘉靖四十三年），一卷。论述脉象２７种，对于脉的体状、相类、主病，都以七言歌括的形式，作了较详尽的介绍。

　　李时珍一生著作很多，在医药学方面，除上述《本草纲目》、《濒湖脉学》之外，还有《奇经八脉考》一卷（１５７２年成书）、《食物本草》二十二卷、《集简方》、《白花蛇传》、《五脏图论》、《命门考》、《命门三焦客难》、《濒湖医案》等书。